11月12日上午11时左右，贝因美旗下生产米粉和固体饮料的全资子公司，杭州贝因美豆逗儿童营养食品有限公司（以下简称豆逗公司），一钢结构厂房滚筒车间着火。据贝因美方面表示，此次火灾在12点左右扑灭，过火面积约200平方米，该厂房总面积为2500平方米。

11月14日，贝因美发布公告称，此次火灾未造成人员伤亡，火灾原因相关部门正在调查，具体财产损失尚在统计中。

值得注意的是，11月8日，国家食药监总局对4家知名奶粉企业食品安全生产规范体系检查结果进行了通报，涉及的奶企名单中就有贝因美。根据公告信息披露，贝因美主要的问题在于部分生产场所、设备设施未持续保持生产许可条件、物料储存和分发制度、检验记录保存制度落实不到位以及硒元素检验能力不足。

11月9日，浙江省食药监局发布公告称，贝因美等3家企业分别在检查结束后的一周内提交了整改计划。目前，3家企业已完成整改，经浙江省食药监局会同辖区食品药品监管部门验收，符合整改要求。

此事后，一周时间不到，贝因美旗下子公司工厂遭遇火灾。据贝因美方面表示，本次受火灾影响的米粉、固体饮料等辅助产品占公司2016年1~9月份总营业收入比例为2.83%，其中米粉占比2.59%。贝因美方面称，会安排子公司北海贝因美营养食品有限公司（以下简称北海贝因美）进行计划调度生产，同时，将采取措施尽快恢复固体饮料类产品的生产供应。

贝因美此前曾募集资金投资北海贝因美“年产6000吨米粉项目”，但在2014年7月22日召开的2014年第三次临时股东大会上，贝因美变更了这个投资项目的议案，将“年产6000吨米粉项目”变更为“年产3000吨米粉项目”，将变更的募集资金投资于年产6万吨儿童奶生产线技术改造项目。

从贝因美公布的2016年上半年财报数据来看，北海贝因美的营业收入为5231.7万元，净利亏损1372.08万元。贝因美方面表示，北海贝因美年产3000吨米粉项目受市场整体环境影响，米粉需求量下滑，未达到保本销量，故未达到预计效益。

高级乳业研究员宋亮说这两年米粉市场产能过剩，而且产品参差不齐。目前市场上有比较大的一些品牌，比如亨氏和贝因美，但总的市场份额不到100亿元，而且整个市场行情不佳。

不过，有业内人士认为，贝因美近几年经历了频繁换帅、中高层团队不稳定以及生产方面问题频出，某种程度上反映了其内部运营可能并不顺畅。